Главной причиной столь значительного падения экспорта кофе стала неожиданная вспышка грибкового заболевания, которое поразило местные кофейные деревья. Согласно отчетам ученых, уровень заболеваемости растений в странах Центральной Америки и, прежде всего, в Мексике, достиг максимальной своей отметки с 1976 года, когда ржавчинные грибы из семейства Pucciniales впервые появились в этом регионе.

Ржавчинный гриб кофейного дерева или Hemileia Vastatrix, который называют "ройя", это - порошкообразные споры оранжевого цвета, которые можно обнаружить на нижней стороне пораженного листа. Затем лист быстро чернеет, опадает. Болезнь значительно ослабляет кофейные деревья и даже способная уничтожить их. Кроме того, она оказывает значительное влияние на на урожайность и качество зерен. Из-за грибка Мексика может лишиться серьезной части своих доходов, которые приходятся на экспорт кофейных зерен.