Основными препятствиями на пути эффективного развития отрасли становится отсутствие доступных кредитных ресурсов, трудности в получении земли при выделении рыбопромысловых участков, проблема утилизации отходов.

Например, Госдума не поддержала законопроект, предложенный карельскими парламентариями, о выделении рыбоводам прибрежной территории для хозпостроек без проведения конкурса. Несмотря на то, что форелеводство остаётся одним из приоритетных направлений развития республиканского АПК, остается нерешенным вопрос переработки отходов рыбоводческих ферм. Форелеводы вынуждены закапывать отходы в лесу, надеясь на создание в ближайшей перспективе специального предприятия.

Отметим, что 70% выращенной в России форели, производят в Карелии и для дальнейшего эффективного развития отрасли необходимы дополнительные меры господдержки рыбоводческих хозяйств.